作者:Michelle Tetreault Carlson 來源:美國MoBio實(shí)驗(yàn)室【字號:大 中 小】 歡迎回來!我們將繼續(xù)回來與大家一起分享一些新穎的不一樣的想法。分享一些客戶常問的技術(shù)問題,以及我們的回答。科學(xué)家們提出了使用我們產(chǎn)品過程中遇到的問題,我們給與了回答,還有什么比這個(gè)較節(jié)省您的時(shí)間? 這周我們我們討論:為什么用酒精作為防腐劑保存環(huán)境樣品不是個(gè)好主意? 問:我們想用PowerSoil DNA Isolation Kit提取從物體表面采集的棉拭子DNA。 對方法上是否有比較好的建議?通常我們會(huì)先潤濕滅菌面前,擦拭物體表面,然后把面前浸入到溶液中(可能是70%)。經(jīng)過適當(dāng)浸泡后,轉(zhuǎn)移一些溶液到PowerBead Tubes中,然后按照說明書進(jìn)行提取。使用酒精會(huì)影響提取結(jié)果嗎? 有沒有從物體表面(如門把等)上采集樣品建議操作方法嗎? 非常感謝! 雖然酒精能成功地保護(hù)龍舌蘭蟲的DNA,但對細(xì)菌并不合用。為什么呢?因?yàn)榫凭S糜谶M(jìn)行分子鑒定前對實(shí)驗(yàn)操作臺(tái)進(jìn)行消毒處理。我們用酒精滅菌。如果用酒精保存用于微生物組分析的棉拭子、土壤等其它樣品,你會(huì)獲得擦拭實(shí)驗(yàn)操作臺(tái)同樣結(jié)果。酒精會(huì)殺死幾乎所有微生物。當(dāng)細(xì)胞壁消失后,DNA會(huì)被釋放到上清液中,從可溶的雜質(zhì)中分離DNA將非常困難。 我們曾經(jīng)嘗試分別從用**、70%和50%酒精保存的土樣中提取DNA,結(jié)果是失敗的。用酒精保存的水樣濾膜也同樣失敗。沒有任何**。 對于棉拭子,較好的保存運(yùn)輸條件是干燥。干燥的物體表面,只要刮取你要檢測的地方即可,不需要用到鹽水。而口腔棉拭子或濕的樣品,讓其在空氣中自然干燥,然后可在-20℃長期保存或運(yùn)輸,室溫也可以。當(dāng)拭子為干燥狀態(tài),上面沾染到的細(xì)菌和真菌就停止生長。我們需要的不是消毒。 因?yàn)镈NA這種強(qiáng)壯的分子能在環(huán)境中保存相當(dāng)長一段時(shí)間,所有我們通常建議土樣或水樣濾膜干燥、冷凍保存和運(yùn)輸。土樣在不同溫度條件下長期保存過程中發(fā)生變化的相關(guān)數(shù)據(jù)正在收集當(dāng)中。有了結(jié)果后我們會(huì)先大家公布。 同時(shí),我們建議準(zhǔn)備使用RNA PowerSoil Kit提取RNA的土樣加入LifeGuard Soil Preservation Solution。加入LifeGuard后的土樣還應(yīng)該盡快放入到冰箱,較好是-20℃,以獲得較原始的RNA當(dāng)然剪影。這是因?yàn)镽NA表達(dá)隨著環(huán)境的變化發(fā)生突然改變。當(dāng)樣品放入到溶液中,微生物的生長繁殖就停止了。 對基于DNA的微生物組學(xué)研究,因?yàn)榛蚪M當(dāng)然不會(huì)馬上發(fā)生改變,原始狀態(tài)保存土壤不加任何額外液體是較簡單、較少干擾和較省錢的辦法。 讓你的微生物樣品遠(yuǎn)離酒精吧。如果你要研究龍舌蘭蝴蝶幼蟲,它是一種很好的防腐劑。是有效放腐,不是消化。如果你想知道門把手或土壤中有哪些微生物,就讓它們保持在原始的生長基質(zhì)中,或干燥的濾紙或棉拭子。它們跟DNA一起保持靜止、完整。
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作者:Michelle Tetreault Carlson 來源:美國MoBio實(shí)驗(yàn)室【字號:大 中 小】 **我們發(fā)布了一篇關(guān)于使用MOBIO試劑盒提取棉拭子DNA的文章。提出了基于PCR抑制因子含量、要提取的是微生物還是真核生物DNA的建議。文章包括了不同試劑盒轉(zhuǎn)移棉拭子到研磨管或者收集管的技巧。棉拭子作為一種較快捷容易的樣品采集方式,一直都是技術(shù)支持的熱門話題。 在**篇棉拭子文章之后,我
來源:深圳市安必勝科技有限公司 轉(zhuǎn)載請注明出處 在之前的文章,我們解說了提取生物薄膜(Biofilm)和生物墊(Biomats)的注意事項(xiàng)。這類物質(zhì)不同于一般的環(huán)境樣品,它們需要特殊的化學(xué)手段降解胞外聚合物(EPS)以釋放其中的細(xì)胞并進(jìn)一步裂解處理。 **紅樹林生態(tài)系統(tǒng)協(xié)會(huì)(ISME)在西澳大利亞舉行的*十三屆展覽會(huì)上,各科學(xué)家問較多的問題是:PowerSoil與較新出的PowerBiofilm
作者:Michelle Tetreault Carlson 來源:美國MoBio實(shí)驗(yàn)室【字號:大 中 小】 注意:如果你是不用微博的人,這篇文章可能會(huì)給你帶來開始玩微博新的動(dòng)力。 自某一天我讀過Arwyn的博文后就再也沒有停下來過!他曾經(jīng)曬出自己大學(xué)課程的研究結(jié)果,關(guān)于為什么薰衣草等常用精油的殺菌效果居然比漂白劑等有毒化學(xué)物質(zhì)較好。多么令人**的結(jié)果!后來我與他**聯(lián)系,經(jīng)過一段時(shí)間后,慢慢了解
作者:Suzanne kennedy 來源:美國MoBio實(shí)驗(yàn)室 我們在產(chǎn)品研發(fā)過程中需要收集大量各種各樣的樣品,然后找出較佳的微生物DNA提取方法。所以當(dāng)我們開發(fā)PowerLyer的操作流程的時(shí)候,希望能找到適合各種樣品的一套方法。我們之前在研究均質(zhì)研磨和研磨珠套管的時(shí)候就知道,根據(jù)土壤類型不同選擇合適的研磨珠可以增加DNA的得率。所以我們決定使用PowerLyzer做一個(gè)類似的研究去回答一個(gè)
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