NGS在應用中面臨的主要挑戰(zhàn)

時間：2021-11-17

作者：廣東省華微檢測股份有限公司

雖然NGS在病原微生物的檢測中有著明顯的優(yōu)勢，但是也依然面臨不少挑戰(zhàn)：

1、參考數(shù)據(jù)庫的完整性。微生物檢測鑒定的準確性很大程度上取決于參考數(shù)據(jù)庫的范圍與完整性；

2、臨床標本的復雜性。臨床標本來源復雜多樣，可能存在病原體信息太少而導致數(shù)據(jù)丟失或病原體數(shù)據(jù)混雜在正常菌群中難以區(qū)分;

3、NGS測序技術的局限性。目前的分析質量依賴于測序質量、基因組組裝的質量以及參考基因組序列的選擇和質量；

4、質量控制和標準化。參考基因組的選擇，分型方法如何選擇等，目前尚未建立不同標本測序前處理和參數(shù)設置的統(tǒng)一標準。

NGS技術被認為是一種較具應用前景的實驗技術，盡管依然路途艱辛，但隨著測序成本的降低以及測序技術的進步，相比較于其他的檢測方法，NGS在病原微生物檢測行業(yè)的優(yōu)勢逐漸凸顯，必將成為臨床診斷的有力工具。目前國內的基因檢測市場空間巨大，臨床醫(yī)師也越來越認識到這項技術的**，加上目前初始階段的從業(yè)者們在參考數(shù)據(jù)庫構建等方面的持續(xù)耕耘，病原微生物基因檢測市場有較廣闊的空間亟待發(fā)掘。

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