化石:從考古“廢料”進行DNA測序

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    化石:從考古“廢料”進行DNA測序

    本期Scientific Reports雜志上介紹了用于通過“古DNA”(aDNA)測序來分析大塊骨頭樣本內(nèi)單一不明碎片的一個新的快速方法。骨頭的小碎片常見于考古和古生物挖掘坑中,但會難以識別,而單一樣本的aDNA分析也會是昂貴的和費時的。

    Michael Bunce及同事提出一個被稱為“bulk-bone”的方法。采用該方法,他們從骨頭粉末的混合樣本中提取和放大時間遠之距今大約46,000年前的aDNA。每個樣本含有來自在澳大利亞兩個考古點(其名稱分別為Devil’s Lair 和 Tunnel Cave)的15個沉積層之一內(nèi)所發(fā)現(xiàn)的50-150個化石碎片的材料。他們對提取的aDNA進行篩選,以尋找可放大的線粒體DNA,后者隨后采用高吞吐量測序方法(一種“元條碼”方法)進行測序。然后,作者完成了一項分類分析,它表明這些樣本含有來自一系列哺乳動物、鳥類和爬行類的DNA。

    對來自發(fā)掘點和測試坑的大塊骨頭樣本進行快速的、高性價比的分析,同時又不會損壞在形態(tài)上重要的樣本,這種方法對考古學(xué)家和古生物學(xué)家來說是一個有**的工具。這些結(jié)果對給這種分析帶來希望的一個方法做了初步演示,并且有可能幫助從原本會被扔掉的樣本中揭示有關(guān)過去生物多樣性的信息。然而,還需要進一步的工作,來可靠地逐步推斷有關(guān)遺傳多樣性的信息, 并將類別鑒定提高到物種水平。


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