GraphPad Prism 10：解鎖新潛力

時間：2023-07-12作者：北京環(huán)中睿馳科技有限公司瀏覽：28

GraphPad Prism是一款統(tǒng)計分析與繪圖軟件，廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)研究領(lǐng)域。它提供了直觀易用的界面和強(qiáng)大的功能，使得科研人員能夠輕松地進(jìn)行數(shù)據(jù)分析、繪制高質(zhì)量的圖表和生成統(tǒng)計報告。 




GraphPad Prism支持各種統(tǒng)計分析方法，包括均值比較、方差分析、回歸分析、生存分析等。用戶可以選擇合適的統(tǒng)計測試，進(jìn)行數(shù)據(jù)的比較和推斷，并得出科學(xué)結(jié)論。同時，軟件還提供了多種圖表類型，如線圖、柱狀圖、散點圖、餅圖等，用戶可以根據(jù)需求自由定制和美化圖表，以展示數(shù)據(jù)的趨勢和關(guān)系。  




此外，GraphPad Prism還具備數(shù)據(jù)管理和數(shù)據(jù)導(dǎo)入功能，可以方便地導(dǎo)入外部數(shù)據(jù)，并對數(shù)據(jù)進(jìn)行整理和篩選。軟件還提供了多種導(dǎo)出選項，使得用戶可以將結(jié)果以多種格式保存，包括圖片、表格和報告文件。GraphPad Prism 10已發(fā)布。




強(qiáng)有力的數(shù)據(jù)分析。高等圖形定制。簡化協(xié)作。

分解數(shù)據(jù)：引入開放的文件格式，實現(xiàn)新的工作流程和集成強(qiáng)有力的數(shù)據(jù)分析。

結(jié)果的簡化解釋：一種新的響應(yīng)式“要么一個，要么沒有”P值匯總風(fēng)格

全的分析：雙向方差分析的默認(rèn)多重比較方法

圖形檢查器：一種新的交互式多變量圖形定制方法

擴(kuò)展的數(shù)據(jù)功能：快的性能和對大數(shù)據(jù)集的支持

使用新工具包裝數(shù)據(jù)：新函數(shù)、新語法、新輸出等等

訪問多結(jié)果：全新的分析常量對話框

簡化協(xié)作：使用Prism Cloud測試版發(fā)布、共享和討論您的工作

還有多！




開放的文件格式

Prism文件包含大量關(guān)于您工作的有用信息：從原始數(shù)據(jù)到您選擇的分析選項和后續(xù)結(jié)果，再到您創(chuàng)建的自定義圖形。但歸根結(jié)底，這都是你的工作。我們相信您應(yīng)該始終能夠訪問它。這也是我們選擇與prism 10一起發(fā)布新的.prosm文件格式的原因之一?！?/span>




該文件格式使用.prsm文件擴(kuò)展名，以可訪問的行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)格式（如CSV、PNG和JSON）存儲原始數(shù)據(jù)、分析參數(shù)和結(jié)果以及自定義圖形。




通過利用先前實驗或分析中收集的數(shù)據(jù)，您可以促進(jìn)有效的數(shù)據(jù)重用，并提高研究的透明度，以便在未來的實驗中做出明智的決定。本著保護(hù)互操作性和可重用性的精神，新的文件格式允許您接受FAIR數(shù)據(jù)原則。




我現(xiàn)有的工作怎么樣？




無論您是剛開始使用Prism還是已經(jīng)使用了幾十年，我們都知道保持對結(jié)果的訪問是多么重要（畢竟，這就是我們初始選擇采用開放格式的原因?。Ｒ虼?，我們不希望您無法訪問您以舊文件格式（擴(kuò)展名為.pzfx或.pzf）生成的任意Prism文件。這就是我們在Prism 10中引入“兼容性模式”的原因。




Prism 10的新功能僅與新的文件格式兼容。當(dāng)嘗試保存為較舊的格式（.pzfx或.pzf）時，Prism將自動檢查文件中是否存在任意這些不兼容之處，并在存在任意不兼容之處時向您發(fā)出警告。如果沒有，文件將按照您的預(yù)期保存。




一種響應(yīng)P值匯總方法




在Prism 10中，我們引入了一種新的響應(yīng)P值匯總方法，使全部人都能很容易地解釋您的結(jié)果。我們新的“一個或無”P值樣式如果P值**用于測試的統(tǒng)計閾值（alpha），則為其*一個星號，如果大于該閾值，則不*星號。




重要的是，與其他P值匯總方法不同，這一方法將始終考慮所使用的alpha值。無論您使用的alpha是0.05、0.01還是任意其他值，您都能夠準(zhǔn)確地解釋此P值摘要。請記住，您應(yīng)該始終報告用于分析的alpha級別。就這么簡單！




為什么這很重要？




對于其他P值匯總方法，0.032的P值可能會被*一個星號（*），導(dǎo)致觀眾錯誤地認(rèn)為它**所選的0.01的阿爾法閾值。然而，當(dāng)使用不同的方法時，這種缺乏清晰度的情況變得加困難。




雙向方差分析多重比較的新選擇

在進(jìn)行雙向方差分析后，通常有興趣檢查多組單獨的成對組比較，也稱為Prism中的“多重比較”。




在Prism 10中，現(xiàn)在可以很容易地執(zhí)行行和列內(nèi)的同時比較，從而提供了一種處理多次比較的簡化方法。以前，這種比較必須單獨進(jìn)行，這增加了復(fù)雜性，并損害了各種比較的校正精度。Prism 10中的這一新功能簡化了流程，確保應(yīng)用適當(dāng)?shù)男Ｕ瑫r能夠有效分析行和列中的比較。




在Prism 10之前，這些比較必須單獨進(jìn)行（一次查看行內(nèi)的比較，另一次查看列內(nèi)的比較）。在Prism 10中，我們添加了這種新的多重比較方法作為新的默認(rèn)選擇。




用于圖形定制和數(shù)據(jù)探索的新工具

我們?yōu)槟鷦?chuàng)建了一種全新的方式來與多變量數(shù)據(jù)交互并從中自定義圖形。新的圖形檢查器通過在一個位置為多個變量圖形組合您喜愛的自定義工具，為數(shù)據(jù)可視化提供了新的控制級別。此側(cè)面板在與圖形交互時始終可用。它提供實時改和可視化新，并能夠比以前快、直觀地繪制氣泡圖。




這也為數(shù)據(jù)探索提供了一種具觸覺的方法，允許您選擇單個數(shù)據(jù)點來高亮顯示它并查看其屬性（從表中），或者再次單擊以高亮顯示其在圖形上的對應(yīng)點組。




訪問的數(shù)據(jù)比以往任意時候都多

任意一個數(shù)據(jù)表中可以包含的列數(shù)都增加了一倍。現(xiàn)在，您至多可以在2048列中擁有數(shù)據(jù)（每個列中至多有512個子列）。這是Prism 10中一行中總共**過100萬個值：這是Excel工作表中一行的64倍！Prism 10還允許您根據(jù)需要打開任意多個窗口，從而取消了僅同時打開16個單獨窗口的限制。




性能改進(jìn)的其他領(lǐng)域包括導(dǎo)出大范圍的數(shù)據(jù)、渲染圖形、在項目文件中的圖紙之間切換、導(dǎo)出圖形和布局以及模擬大量數(shù)據(jù)。




訪問比以往任意時候都多的結(jié)果

分析常量對話框（也稱為“Hook常量對話框”）的組織結(jié)構(gòu)得到了較大的改進(jìn)?，F(xiàn)在，結(jié)果被組織成一個易于導(dǎo)航的樹結(jié)構(gòu)，每個分析都有多個層次的組織，可以很容易地深入到感興趣的特定值。該樹結(jié)構(gòu)與Prism內(nèi)部用于將計算結(jié)果存儲在新文件格式中的結(jié)構(gòu)相同，使全部人都可以輕松查看這些值（即使沒有Prism?。?。




“分析常量”對話框現(xiàn)在涵蓋了Prism分析的整個庫。以前版本的Prism中分析常量對話框中沒有的雙向方差分析等分析結(jié)果現(xiàn)在可以鏈接。




使用所有新工具整理數(shù)據(jù)

Prism 10為多變量數(shù)據(jù)表引入了一系列新工具，幫助您的數(shù)據(jù)做好分析和繪圖準(zhǔn)備。這包括使用“提取”和“重排”將多變量數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為Prism的其他數(shù)據(jù)表結(jié)構(gòu)時的新選項，以及可用于“選擇和變換”分析的新變換。




Prism Cloud Beta：協(xié)作變得簡單

Prism Cloud測試版是一款全新的基于web的應(yīng)用程序，允許您發(fā)布、共享和與同事討論您在Prism中已經(jīng)完成的工作。隨著Prism 10的發(fā)布，Prism Cloud工作區(qū)將開始為選定的Prism訂閱自動創(chuàng)建。登錄Prism Cloud并訪問Prism Cloud工作區(qū)后，您所要做的就是打開Prism文件，單擊Prism Cloud工具欄圖標(biāo)，然后將您的作品發(fā)布到Prism Cloud。




從那里，您可以與工作區(qū)的其他成員共享您的工作，或者邀請其他Prism Cloud用戶直接查看您的工作。在查看您的工作時，其他人可以通過在您發(fā)布的項目中創(chuàng)建討論直接為您提供反饋。停止來回發(fā)送電子郵件，開始快地獲得您需要的反饋！




增強(qiáng)的功能和改進(jìn)




新功能




全新的文件格式

創(chuàng)建和自定義多變量圖的所有新方法

圖形檢查器

重新設(shè)想格式的圖形對話框

無限圖形畫布

全新的圖形引擎，從頭開始構(gòu)建，具有*特的功能

選擇以**顯示（組）

實時定制

Prism Cloud集成

大快

主要性能改進(jìn)

增加了數(shù)據(jù)限制（2048）

多你所愛的

新的P值樣式

雙向方差分析后多重比較的改進(jìn)

新的多重比較方法

選擇特定比較




數(shù)學(xué)功能




擴(kuò)展的選擇和轉(zhuǎn)換分析功能




引入了能夠創(chuàng)建分類變量的“IF（）”函數(shù)。例如IF（A<18，“兒童”，“成人”）




增加了標(biāo)準(zhǔn)轉(zhuǎn)換函數(shù)：min（變量）、max（變量）和mean（變量）




引入了一個連接函數(shù)來創(chuàng)建分類變量。例如，如果A=“Smith”和B=“John”，則連接（B，“”，A）=“John-Smith”（注意中間的“”在兩個*值之間引入了一個空格）




在使用“變量與值”選擇行時添加了“不丟失”選項




為其他用戶定義函數(shù)引入了額外的轉(zhuǎn)換工具（例如，在非線性回歸中）




“與”和“或”函數(shù)的替代形式。以前，Prism會期望形式（X>3 AND X<10）。Prism 10接受等效形式AND（X>3，X<10）




使用IF（）函數(shù)時，可以將null值*為“”或使用null。例如，如果Y值為空，函數(shù)if（Y=“”，5,10）將返回值5。如果Y不為空，它將返回10。類似地，如果Y=5，函數(shù)if（Y=5，NULL，3*Y）將返回一個空缺（NULL）值




介紹了一種新的雙向方差分析的多重比較方法：比較僅相差一個因子的細(xì)胞的平均值。在行和列內(nèi)同時執(zhí)行多個比較，同時正適當(dāng)?shù)谋容^總數(shù)




增加了在雙向方差分析后進(jìn)行多重比較時選擇特定比較的能力




較大地擴(kuò)展了使用“分析常數(shù)/掛鉤常數(shù)”對話框可以掛鉤的分析常數(shù)（結(jié)果）的數(shù)量




新了“變換”對話框中函數(shù)的命名（以及其他相關(guān)分析）。為了保持一致性，所有函數(shù)現(xiàn)在都是小寫（例如，我們現(xiàn)在在“轉(zhuǎn)換”對話框中使用“日志”而不是“日志”）




添加了一個新的響應(yīng)P值摘要樣式：“一個或無”。對于這種樣式，任意***阿爾法閾值的P值都將被分配一個星號，而所有其他P值將被分配“ns”（在使用FDR校正方法的情況下為“nd”）。如果alpha發(fā)生改，這些P值摘要分配將自動新




當(dāng)使用比較校正的FDR方法時，新了成對比較的行為。在這種情況下，將始終使用新的“一個或無”P值樣式，并且浮動注釋將解釋添加的星號的解釋。此外，摘要“nd”用于表示“未發(fā)現(xiàn)”




介紹了在使用提取和重排分析創(chuàng)建XY表時定義主題/復(fù)制變量的能力。所選變量的值將成為創(chuàng)建的表的子列標(biāo)題




改進(jìn)了當(dāng)使用“總分?jǐn)?shù)”分析且存在空缺（排除）行或列時顯示的浮動注釋的措辭




非數(shù)學(xué)




將可添加到每個數(shù)據(jù)表的數(shù)據(jù)列數(shù)增加一倍（從以前版本的Prism中的1024列增加到Prism 10中的2048列）




刪除了對可以同時打開的文檔數(shù)量的限制（以前版本的限制為16




在“選擇和變換”對話框中添加了“全選”和“取消全選”指令




添加了上下文菜單指令，用于在多變量圖上按大小或顏色選擇數(shù)據(jù)點




新了多變量圖形上顏色分配的行為，以便圖形的顏色范圍基于源數(shù)據(jù)表中的數(shù)據(jù)范圍，而不是圖形上顯示的數(shù)據(jù)




介紹了使用“雙擊”方法根據(jù)大小或顏色選擇數(shù)據(jù)組的能力




新了多個變量圖形圖例的行為，使其范圍基于源數(shù)據(jù)表中的數(shù)據(jù)范圍，而不是圖形上顯示的數(shù)據(jù)




新了帶有負(fù)數(shù)的軸前綴的行為，使其出現(xiàn)在負(fù)數(shù)和值之間（而不是出現(xiàn)在負(fù)數(shù)之前）




為.pzf和.pzfx文件實現(xiàn)了“兼容性模式”，允許在Prism 10中無縫訪問這些遺留文件格式




在檢驗到公式錯誤的情況下，改進(jìn)了Prism公式編輯器中光標(biāo)放置的行為




（Windows）啟用從蒙特卡洛結(jié)果表調(diào)用的“改”菜單中的“數(shù)據(jù)分析…”項




（Mac）為圖形上的“帶星號的直線”對象啟用主菜單指令“排列”>“位置對象”




（Mac）新了Cmd+Backspace鍵盤快捷鍵的行為。在表上且不處于編輯模式時，此快捷方式將清理選定的單元格。在編輯模式下，此鍵盤快捷鍵將清理從行開始到當(dāng)前光標(biāo)位置的文本。在以前版本的軟件中，即使在文本編輯模式下，此快捷方式也可能已清理選定的單元格，這是意外的




表現(xiàn)

Prism 10經(jīng)過優(yōu)化，在以下情況下比Prism 9快：




保存Prism文件（尤其是包含大量數(shù)據(jù)的文件）




從數(shù)據(jù)表中導(dǎo)出大范圍的數(shù)據(jù)




渲染圖形




在工作表之間切換




導(dǎo)出圖形和布局




模擬大量數(shù)據(jù)




修正了以前導(dǎo)致錯誤結(jié)果的分析錯誤




修正了使用“變量與值”功能選擇行時選擇和轉(zhuǎn)換分析的問題，而輸入數(shù)據(jù)包含所選變量的空缺值。在某些情況下，這些空缺行被錯誤地返回為與選擇條件匹配




修正了其他與分析相關(guān)的Bug




修正了“選擇并變換”分析，因此如果沒有為自定義變換提供標(biāo)題，Prism將使用參數(shù)對話框中下拉菜單中的變換定義。請注意，在為這個新變量生成的（綠色）結(jié)果表中不會使用任意標(biāo)題




修正了“刪除基線和列數(shù)學(xué)”分析結(jié)果顯示較小值而不是“0”的問題




修正了在“參考水平”選項卡中為分類變量選擇自定義項目后，在多元線性回歸參數(shù)對話框的“插值”選項卡中意外重置“一級（默認(rèn)）”項目的問題




將結(jié)果選項卡的名稱從“Mean diff.CI plot”改為“an of ratio CI plot”，創(chuàng)建時選擇了“Graph CI of geometric means of ratio”選項，以進(jìn)行比率配對t檢驗




修正了“提取并重新排列”分析生成的結(jié)果中帶有變量的列的順序，以正確說明負(fù)值




修正了“多重t檢驗”分析結(jié)果表中用于多重比較的?ídák-Bonferroni方法名稱中的拼寫錯誤




啟用“參數(shù)：簡單線性回歸”對話框中min和max值的“使此選項卡上的選項成為未來擬合的默認(rèn)選項”




（Windows）在“參數(shù)：模擬列數(shù)據(jù)”對話框中為**過256的數(shù)據(jù)集啟用掛鉤按鈕




(Windows)解決了在"表格"中選擇不合適的表格的問題。"分析數(shù)據(jù)"對話框"蒙特卡洛"分析"部分 




(Windows)解決了"參數(shù):蒙特卡洛"對話框"參數(shù)表"標(biāo)簽分析常樹中出現(xiàn)的信任區(qū)間標(biāo)題損壞問題 




(Windows)可以在"參數(shù):模擬XY數(shù)據(jù)"對話框的"參數(shù)值和列標(biāo)題"選項卡中選擇**過256個數(shù)據(jù)集 




(Windows)解決了Prism在試圖為非線性回歸分析創(chuàng)建一個新的方程時會崩潰的問題 




解決了"參數(shù):選擇和轉(zhuǎn)換"對話框中排除源數(shù)據(jù)表中一個值時丟失轉(zhuǎn)換定義的問題 




解決了"參數(shù):多重邏輯回歸"對話框選項卡中在修改"模型"選項卡上的結(jié)果值后沒有自動新結(jié)果標(biāo)簽的問題




在修改了軸范圍的min值和max值之后,解決了圖表上顯示意外值而不是"0"的問題




圖像錯誤




修正了在畫廊視圖模式下沒有新圖預(yù)覽的問題 




修正了一個問題,即使用"日志10"比例尺的左Y軸編號在布局表中的圖表中意外地被剪掉。 




將位置對象對話框中的角度輸入限制在360度 




(窗口)解決了以下問題:如果使用**過1000個單元格生成圖形,則將符號在分組的交叉圖上剪下 




解決了將多個變量圖導(dǎo)出到Tif或PNG文件格式時缺少透明度的問題 




解決了這樣一個問題,即在"單向變異數(shù)分析"之后對選定的兩列進(jìn)行對對比較時,沒有使用特征轉(zhuǎn)移到新的圖中


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