SnapGene 日常分子生物學(xué)軟件

時(shí)間：2022-09-08作者：北京天演融智軟件有限公司瀏覽：573

SnapGene是可視化和記錄您日常分子生物學(xué)過(guò)程的較簡(jiǎn)單的方法。

 

可視化

當(dāng)您可以準(zhǔn)確地看到自己在做什么時(shí)，克隆就較簡(jiǎn)單了。

 

DNA可視化

查看DNA序列的多個(gè)視圖。

                                             

查看自動(dòng)生成的DNA結(jié)構(gòu)的圖形歷史記錄。祖先序列可以作為單獨(dú)的文件恢復(fù)。

 

支持分析大型序列

瀏覽染色體大小序列。




利用SnapGene高效的數(shù)據(jù)處理能力掃描具有數(shù)千個(gè)注釋特征的大型DNA序列。

 

蛋白質(zhì)可視化

查看蛋白質(zhì)序列的多個(gè)視圖。




自定義區(qū)域、站點(diǎn)、綁定和序列顏色的顯示。

 

 

直觀的序列編輯功能

輕松編輯DNA和蛋白質(zhì)序列。




進(jìn)行插入、刪除、替換和大小寫更改。復(fù)制和粘貼序列時(shí)，將自動(dòng)轉(zhuǎn)換功能要素。

 

序列顏色編碼

將選定的DNA或氨基酸序列設(shè)置為這十種顏色其中之一。

 




為兩條DNA鏈或蛋白質(zhì)序列著色。 顏色在“映射”和“序列”視圖中均可見。

功能注釋

自動(dòng)標(biāo)注常用功能，或手動(dòng)標(biāo)注新功能。




使用SnapGene廣泛的數(shù)據(jù)庫(kù)查找DNA序列中的共同特征。 您選擇的其他功能可以添加到自定義數(shù)據(jù)庫(kù)中。

 

模擬

SnapGene提供了美觀，信息豐富的窗口，可用于模擬各種常見的克隆和PCR方法。

 

限制站點(diǎn)指示器

確認(rèn)限制站點(diǎn)適合克隆。




以粗體**顯示*特的限制性位點(diǎn)，或選擇自動(dòng)定義Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶組。

 

限制性克隆

可視化克隆過(guò)程的所有細(xì)節(jié)。

 




如果您已經(jīng)有了一個(gè)克隆過(guò)程的想法，那么模擬將僅花費(fèi)幾秒鐘。如果克隆過(guò)程存在設(shè)計(jì)缺陷，還可以捕獲并糾正錯(cuò)誤。

 

PCR

模擬標(biāo)準(zhǔn)PCR。




使用您自己的引物，或要求SnapGene自動(dòng)設(shè)計(jì)引物。產(chǎn)品文件將模板和引物存儲(chǔ)在其歷史記錄中。

 

重疊延伸PCR

重疊延伸PCR法融合片段。




較多組裝八個(gè)碎片。選擇要連接的片段及其定位，SnapGene設(shè)計(jì)引物。




引物定向突變

使用突變引物進(jìn)行**突變。




選擇一個(gè)致突變引物，然后按一下按鈕查看修改過(guò)的質(zhì)粒。歷史色彩凸顯了這一變異。

 

Gateway克隆

模擬Gateway BP克隆或LR克隆，或同時(shí)模擬兩者。 

 




為了方便，還提供了共同的供體向量和目標(biāo)向量。選擇要組裝的片段，SnapGene即可設(shè)計(jì)引物。

 

Gibson組裝

通過(guò)融合較多8個(gè)片段，或?qū)⑤^多8個(gè)片段插入向量，模擬Gibson程序集。Gibson Assembly是一種流行的無(wú)縫克隆方法。




選擇要融合的片段及其方向，SnapGene即可設(shè)計(jì)引物。線性化后的載體可以通過(guò)酶切或反向PCR產(chǎn)生。

 

In-Fusion克隆

通過(guò)將較多八個(gè)片段插入一個(gè)載體來(lái)模擬Clontech的In-Fusion克隆。 融合克隆是創(chuàng)建無(wú)縫基因融合的一種非常通用的方法。




選擇要融合的片段及其方向，SnapGene即可設(shè)計(jì)引物。線性化后的載體可以通過(guò)酶切或反向PCR產(chǎn)生。

 

TA和GC克隆

通過(guò)TA或GC克隆捕獲PCR產(chǎn)物。




選擇傳統(tǒng)的TA克隆或高效的GC克隆。

 

為了方便起見，提供了常用的TA克隆載體和Lucigen的GC克隆載體。

 

Annealing Oligos

將兩個(gè)寡核苷酸重組以形成雙鏈產(chǎn)物。




使用簡(jiǎn)單控件為限制克隆添加懸挑。

 

避免錯(cuò)誤

使用SnapGene，確保構(gòu)造符合您的要求，并確認(rèn)您獲得了所需的序列。

 

基因融合閱讀框

確保構(gòu)造中的轉(zhuǎn)換功能位于框架中。




使用序列視圖可以查看兩個(gè)已翻譯的特征是否在框架中。

 

與參考序列對(duì)齊

使用功能強(qiáng)大的對(duì)齊工具檢查實(shí)際構(gòu)造是否與模擬構(gòu)造匹配。




請(qǐng)參見對(duì)齊序列與參考序列匹配的位置以及存在差異的位置的概述。

 

 

自動(dòng)記錄

SnapGene自動(dòng)記錄創(chuàng)建圖形歷史的操作，并將祖先構(gòu)造存儲(chǔ)在較終文件中。

 

全面的“撤消”功能

撤消幾乎所有操作。

 




不要覺得使用SnapGene文件很復(fù)雜--追溯這些步驟很*。

 

歷史和嵌入原型序列

查看構(gòu)造的圖形歷史記錄。




 

單擊某個(gè)操作以**顯示父序列和產(chǎn)品序列的相關(guān)部分，或單擊PCR引物名稱以查看引物序列。

 

單擊歷史樹中的原型以重新生成該原型序列文件，包括其注釋和克隆歷史。

 

歷史記錄顏色

使用可選的歷史記錄標(biāo)上顏色來(lái)標(biāo)識(shí)序列的較新更改。




查看有關(guān)組裝結(jié)構(gòu)的詳細(xì)信息，包括結(jié)扎的粘性末端。

 

擁有您的數(shù)據(jù)

SnapGene可以幫助您選擇讀取和共享文件，同時(shí)保持對(duì)數(shù)據(jù)的完全控制。

 

安全文件管理

把您的SnapGene文件放在您想要的地方。

 




使用您熟悉的、安全的計(jì)算機(jī)操作系統(tǒng)來(lái)存儲(chǔ)和管理SnapGene文件。

 

從其他格式導(dǎo)入

支持讀取許多常見的文件格式。

 

不僅可以導(dǎo)入DNA序列，還可以導(dǎo)入功能注釋和注解。

 

導(dǎo)出標(biāo)準(zhǔn)格式

將序列，圖譜或凝膠圖像轉(zhuǎn)換為標(biāo)準(zhǔn)格式，以與其他軟件一起使用。




 

將序列導(dǎo)出為GenBank或FASTA格式。將地圖或模擬的瓊脂糖凝膠導(dǎo)出為常見的圖像格式。

 

與SnapGene Viewer共享數(shù)據(jù)

將SnapGene格式的文件發(fā)送給同事或客戶，他們可以下載免費(fèi)的SnapGene Viewer來(lái)瀏覽這些文件。




只需將文件連同鏈接發(fā)送到SnapGene Viewer。就像完整的SnapGene界面一樣，接收者將能夠看到圖譜、序列和注釋。

 

對(duì)于開發(fā)人員

如需將SnapGene整合到您的數(shù)據(jù)分析或?qū)嶒?yàn)室管理軟件中，請(qǐng)聯(lián)系我們以獲取有關(guān)如何讀寫SnapGene文件的信息。

 

轉(zhuǎn)換文件格式

信息的公開交換至關(guān)重要，因此SnapGene和SnapGene Viewer提供了用于讀取和導(dǎo)出常用文件格式的選項(xiàng)。

 

從另一種格式導(dǎo)入時(shí)，目標(biāo)不僅是捕獲DNA序列，還要捕獲注釋和注解。如果在導(dǎo)入文件時(shí)遇到故障，或者想要支持新的文件格式，請(qǐng)與我們聯(lián)系。

 

系統(tǒng)需求

SnapGene可適用于Windows和Mac系統(tǒng)。




北京天演融智軟件有限公司（科學(xué)軟件網(wǎng)）是 SnapGene 軟件在中國(guó)的授權(quán)經(jīng)銷商，為中國(guó)的用戶提供優(yōu)質(zhì)的軟件銷售和培訓(xùn)服務(wù)。








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