ChromasPro DNA序列分析軟件

時間：2020-12-09

ChromasPro適用于DNA序列組裝項目，可達到幾兆字節(jié)，并進行基本序列編輯和分析。它能夠從Sanger序列器，比如ABI，454和Illumina下一代序列器中組裝數(shù)據(jù)，如果有8GB的可用內存，則較多可組裝1,000,000個序列。

ChromasPro具體功能

? 打開Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和純文本格式中的序列。

? 以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。

? 使用圖形界面組裝重疊序列，生成一致性并**模糊性進行編輯。

? 使用高質量數(shù)據(jù)自動去除低質量序列以改進序列組裝。

? 使用參考序列作為組裝的支架。

? 生成限制位點和片段圖，并列出切割，非切割和片段。

? 映射開放閱讀框，由G+C框架圖輔助，并用一次點擊翻譯ORFs。

? 打印色譜圖，限制位點和片段圖，和開放閱讀框架圖。

? 通過NCBI網站進行核苷酸和蛋白質BLAST搜索。

? 與ClustalW接口執(zhí)行多個對齊。

? 反向互補序列和色譜圖。

? 通過精確匹配或較優(yōu)對齊搜索序列。

? 編輯核苷酸序列時顯示翻譯。

? 進行反向翻譯并繪制核苷酸簡并。

? 繪制蛋白質的親水性和抗原性。

? 復制色譜切片的圖像，粘貼到文檔或演示文稿中。

系統(tǒng)需求

Compatible with Windows XP, Vista, 7, 8, 10.

更多詳情請登陸 科學軟件網 。

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詞條
詞條說明
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