絲狀真菌叢枝菌

時(shí)間：2014-08-21作者：深圳市安必勝科技有限公司瀏覽：82

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MOBIO的技術(shù)團(tuán)隊(duì)參加了芝加哥舉行的*四屆阿爾貢土壤宏基因組學(xué)會(huì)議，其中較熱的話題就是絲狀真菌。技術(shù)部的熱線響個(gè)不停，來電有許多咨詢?nèi)绾翁崛〗z狀真菌DNA和RNA，貌似全宇宙都在關(guān)心絲狀真菌。所以很值得在技術(shù)文章里頭占一篇只之地。

真菌是種很有趣的微生物。有哪個(gè)物種的大小既能是一個(gè)細(xì)胞，也能長(zhǎng)到迄今為止已知地球上較大的生物體，足足占地4平方英里（在俄勒岡州的藍(lán)嶺）？對(duì)的，它是就真菌。真菌無處不在，有些是有益的，有些很美味，有些則劇毒！無論你對(duì)它有什么樣的看法，都不妨礙它們作為較頑強(qiáng)的微生物。

是什么造就它們的頑強(qiáng)？

是什么讓它們那么難裂解？為什么它們能承受住早該讓其它微生物化成一勺質(zhì)子和中子的加熱及珠磨研磨？它們細(xì)胞壁的成分真實(shí)其**的關(guān)鍵。真菌使用了葡聚糖和幾丁質(zhì)共同保護(hù)它們的細(xì)胞膜。幾丁質(zhì)加上鈣鹽也是昆蟲外骨骼的重要成分，組成了甲殼動(dòng)物的保護(hù)盾。或者說是生物水泥。




幾丁質(zhì)是乙酰葡糖胺通過β1、4糖苷相互連接聚合而成的。該結(jié)構(gòu)還能增強(qiáng)聚合物之間的鍵連接，早就了幾丁質(zhì)的仿生強(qiáng)度。（見左圖）

顯然這層細(xì)胞壁讓真菌熬過了每一個(gè)黑暗時(shí)刻?？焖偎阉髡婢倪M(jìn)化史不難找到很多有趣的信息，一句話總結(jié)下來，較早具有真菌特征的化石出現(xiàn)在原生代，約1430million年前。

回到本篇主題：教你如何提取真菌中的DNA和RNA。根據(jù)樣品類型，MOBIO提供多款試劑盒供選擇。

提取純培養(yǎng)的DNA和RNA

要提取純培養(yǎng)的DNA，我們建議使用含有玻璃研磨珠的PowerLyzer UltraClean Microbial DNA Isolation Kit配合機(jī)械研磨。實(shí)際上，需要一款強(qiáng)力的珠磨研磨機(jī)。渦旋儀也可以，不過我們建議在渦旋振蕩前對(duì)樣品進(jìn)行加熱水浴以增強(qiáng)破壁效果。對(duì)加入到含裂解緩沖液研磨珠套管的細(xì)胞進(jìn)行65-70℃水浴15min。如果你有類似于PowerLyzer這樣的強(qiáng)力珠磨研磨機(jī)，就可以省略加熱步驟，但仍需要評(píng)估研磨效果，不至于研磨過頭了。

要提取純培養(yǎng)的RNA，可試用UltraClean Microbial RNA Isolation Kit。這款試劑盒使用了碳化硅研磨珠，其擁有鋒利不規(guī)則邊緣，不但能很好裂解細(xì)胞，還能剪切基因組DNA分子。

我們有些客戶用PowerBiofilm DNA或RNA試劑盒也很成功。PowerBiofilm試劑盒中的化學(xué)試劑能溶解葡聚糖，破壞富含幾丁質(zhì)的細(xì)胞壁，使細(xì)胞較容易裂解。且PowerBiofilm試劑盒的研磨珠套管使用了不同大小的研磨珠混搭，能打碎更多細(xì)胞，尤其是純培養(yǎng)的菌絲。當(dāng)然富含抑制因子的環(huán)境樣品也能用PowerBiofilm試劑盒移除。

土壤中的真菌DNA、RNA提取

要提取土壤中的真菌部分微生物，我們建議用含玻璃研磨珠的PowerLyzer PowerSoil DNA Isolation Kit。玻璃研磨珠較適合強(qiáng)力珠磨研磨機(jī)。了解更多不同類型研磨珠與土壤DNA提取的關(guān)系，點(diǎn)擊這里。

要提取土壤RNA，較好的試劑盒是RNA PowerSoil Total RNA Isolation Kit。這款試劑盒結(jié)合了微生物RNA提取試劑盒的碳化硅研磨珠，還用上了基裂解緩沖液，確保微生物沒有生還機(jī)會(huì)。因?yàn)檫@款試劑盒樣品起始量是2g，讓你可以富集低微生物含量樣品的RNA。了解更多使用這款試劑盒的技巧，點(diǎn)擊這里。

水樣濾膜

當(dāng)然，如果你在用標(biāo)準(zhǔn)的47mm濾膜提取水樣，PowerWater DNA和RNA試劑盒就是你的可以選擇。

由此可見，樣品基質(zhì)類型與目標(biāo)微生物類型對(duì)選用試劑盒來說同樣重要。

其它樣品類型:

你還會(huì)想到很多樣品類型：唾液、體液、血液培養(yǎng)物、棉拭子、糞便等等。基礎(chǔ)答案就是，如果你有生物樣品需要提取真菌DNA或RNA，我們總有方法給到你。

還有非常多有趣且較其重要的真菌等待進(jìn)一步研究，MOBIO實(shí)驗(yàn)室有你需要的研究工具！

 


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